Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED1Q99966 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED1Q99966 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CITED1Q99966 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms