Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITX2Q99697 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITX2Q99697 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms