Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms