Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KC1Q96S38 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms