Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRAMP1Q96RY5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms