Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC4A9Q96Q91 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A9Q96Q91 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms