Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms