Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OPALINQ96PE5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms