Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGD4Q96M96 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms