Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNBD2Q96M20 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms