Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHAMP1Q96JM3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms