Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms