Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A3Q96HJ5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms