Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms