Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms