Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTHRC1Q96CG8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms