Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP4CQ96CF2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms