Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RUNDC1Q96C34 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms