Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TOPBP1Q92547 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOPBP1Q92547 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms