Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAAF4Q8WXU2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms