Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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COPS9Q8WXC6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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