Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF4Q8WV16 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms