Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms