Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FNDC9Q8TBE3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FNDC9Q8TBE3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms