Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms