Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC112Q8NEF3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms