Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLIS3Q8NEA6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLIS3Q8NEA6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms