Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPC24Q8NBT2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPC24Q8NBT2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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