Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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FAM71DQ8N9W8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM71DQ8N9W8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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FAM71DQ8N9W8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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FAM71DQ8N9W8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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FAM71DQ8N9W8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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FAM71DQ8N9W8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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FAM71DQ8N9W8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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FAM71DQ8N9W8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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FAM71DQ8N9W8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM71DQ8N9W8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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