Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYB561D1Q8N8Q1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms