Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC71Q8IV32 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms