Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE3BQ7Z3V4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms