Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY3Q7L099 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms