Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC80Q76M96 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms