Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD6Q6ZV73 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms