Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENND5BQ6ZUT9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DENND5BQ6ZUT9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms