Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms