Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC9Q6ZRR7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms