Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WDR88Q6ZMY6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms