Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms