Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CASC2Q6XLA1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms