Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL4Q6XD76 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms