Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCL17Q6UXB2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL17Q6UXB2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms