Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms