Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSSK4Q6SA08 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSSK4Q6SA08 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TSSK4Q6SA08 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSSK4Q6SA08 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSSK4Q6SA08 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSSK4Q6SA08 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSSK4Q6SA08 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSSK4Q6SA08 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms