Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC174Q6PII3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms