Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
APOBEC3HQ6NTF7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms