Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE12Q6L8Q7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms