Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CARMIL2Q6F5E8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms