Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOCADQ5VW36 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOCADQ5VW36 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms